Owocowe stworzenia w grze łączą Fruits 3D proszą o uzupełnienie ich szeregów nowymi owocami. Aby to zrobić, wyrzucisz owoce na boisko, próbując nacisnąć pary tego samego. Spowoduje to pojawienie się nowych owoców lub jagód w łączeniu owoców 3D! Kiedy utworzysz ostateczne owoce, gra się zakończy.