Niebieska kostka w Cube Runner będzie pokonywać przeszkody na drodze do mety, a Twoim zadaniem jest nie dopuścić do zderzenia się z czerwoną kostką - to jej najstraszniejszy wróg. Kontakt z nim wyrzuci Cię z poziomu. Pozostałe bloki można przesuwać i za ich pomocą usunąć wroga z drogi.