Bohaterem gry Jelly Runner jest galaretowata kostka, która daje mu przewagę w pokonywaniu bram o różnych rozmiarach. Rozciągaj lub kurcz kostkę odpowiednio do napotykanych przeszkód, aby z łatwością je pokonać i dotrzeć do mety. Jeśli nie masz czasu na zmianę kształtu, kostka się rozpadnie.