Logicznie rzecz biorąc, w świecie technologii cyfrowych wszystko powinno być w porządku, jeśli wirus nie ingeruje w system. I tak właśnie stało się w Cyber Subsist. Maszyny zbuntowały się i bohater gry będzie musiał je spacyfikować bronią. aby samemu nie stać się ofiarą, zręcznie steruj bohaterem.